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TCGA数据分析
3篇文章 · 169字 · 3人关注
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    第六步：mRNA的差异表达

    deseq2 edg limma 区分

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    第二步：TCGA数据差异分析整理

    安装软件 对于差异基因我们有三个R包，DESeq，edgeR，和limma包，三个包都可以，作者更倾向于DESeq包，这个包也太慢了，建议睡前跑...

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    第一步：TCGA数据提取

    下载数据 利用tcga官网gdc下载RNA和clinical数据,这是胃腺癌的代码，可以全程套用,340例癌，33例癌旁。 整理临床信息 整理表...

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