Avatar notebook default
生物信息学
10篇文章 · 3245字 · 5人关注
  • Resize,w 360,h 240
    根据基因名称批量提取基因序列

    实验中经常需要从基因组中提取、序列用于设计引物，或者进行基因功能研究等，之前看到别人使用的一个脚本，自己拿来用一下，感觉确实很方便 在网站[ht...

    0.3 2827 0 10
  • Resize,w 360,h 240
    samtools 序列比对率计算（samtools flagstat）

    准备序列比对后生成的 bam 文件或者 .sam 文件 结果解释从第一行至第十一行分别表示： QC pass的reads的数量为2499971，...

    2.1 8863 0 6
  • bedtools 批量提取snp前后1000bp片段

    准备条件1 知晓snp位置，位于第 x 条染色体上 12345678 bp2 生成 .txt 文件，文件格式如下 第一列表示 snp 染色体位...

    0.8 968 0 6
  • Linux 离线运行程序

    这里用到的 screen 程序，需要 conda 安装 conda install screen 相关操作命令 screen -S w1 新建一...

    825 0 0
  • 如何在Linux下设置缩写命令

    平时我们会用到一些缩写，比如 ll 代表 ls -als 等，下面就是如何设置的问题 在 linux 系统 home 目录下找到自己的 .bas...

    0.8 2019 1 5
  • 生物信息学之 anconda / miniconda

    之前在构建生物信息学环境里面已经介绍了这个区别，也可以参考这个知乎链接https://zhuanlan.zhihu.com/p/35711429...

    0.1 554 0 1
  • Resize,w 360,h 240
    生物信息学需要掌握的 Linux 基础操作

    符号 / : 根目录 （写入绝对路径）~ : 自己的home目录. : 当前目录.. : 上一层目录 （写入相对路径） 查看命令 ls -l (...

    2.5 797 0 9
  • NCBI 数据介绍和下载

    本来打算自己写一个，但是太懒了，感觉别人写的也很详细，我也写不出什么花，就在这直接做一个只是整理： NCBI 扫盲NCBI上的这些字母都是什么鬼...

    0.8 959 0 5
  • 构建生物信息学环境-2 （anconda/minniconda）

    关于 anconda 的介绍和安装我直接贴一个孟浩巍大神的知乎帖子就好了，写的很详细，我也是按照那个方法一步步试下去的。https://zhua...

    0.3 1484 0 4

文集作者