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又双叒叕一个大豆T2T基因组发表了
前不久才刚总结完大豆T2T基因组：哪个才是首个（中国）大豆的T2T基因组版本？[https://mp.weixin.qq.com/s/WOJT3...
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康奈尔大学生物信息中心主任关于基因组组装报告Dr. Qi Sun是康奈尔大学高级研究员和生物信息学中心主任，长期以来从事生物信息学工作，在大数据的管理与分析上，特别是Genotype-By...
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如何快速纠正VCF文件中REF和ALT的位置错误？需求描述 一个很简单的需求：一批水稻材料的芯片数据（位点少），想看看它们在3K Rice中处于何种亚群和位置。就需要将芯片位点与3K RG位点整...
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植物图形泛基因组Graph-based pan-genome图形泛基因组（图泛）以节点和路径的形式存储和展示物种的变异信息，关键作用是扩展线性参考基因组的坐标系统，以容纳更多的遗传多样性区域。本文首先总结...
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基因挖掘之BSA (Bulk segregation analysis)BSA作为基因组学中基因挖掘的三板斧之一，最大优点是高效、经济、简便。通过选择双亲群体分离后代中具有极端表型的个体进行混样，然后比较不同极端混样...
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如何快速简化vcf信息？
需求描述 vcf是标准的基因型格式文件，其中包含的信息可多可少。主要在于INFO可无限扩展特征，以及每个样本的FORMAT信息，会大大增加vcf...
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【报告笔记】作物顺式调控模块的挖掘与利用背景 调控基因的表达可实现植物表型和重要农艺性状的定向改变 • SV影响基因表达 （2020，Cell: Major Impacts of Wi...
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【报告笔记】基因组组装的最后挑战-T2T
长读长组装发展 2012：三代组装、二代校正；耗资源，适合小基因组，如细菌，4-15%错误率 2013：三代组装、三代校正；仍然只适用小的 20...
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