单细胞测序数据分析 - 文集

5篇文章 · 1279字 · 1人关注

Seurat AddModuleScore后方便的更改meta.data中的列名
obj <- AddModuleScore(obj, signature) new.clus <- grep(pattern="Cluster\...

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文章复现 | 单细胞测序揭示COVID-19患者支气管肺泡免疫细胞图谱
摘要：对Nature Methods上发表的文章Single-cell landscape of bronchoalveolar immune ...

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文章复现 | WGCNA算法识别肾透明细胞癌CD8T细胞浸润相关关键基因
前言：加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis，WGCNA）是研究相似基...

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一文学会 | Seurat2整合不同技术的单细胞测序数据并去除批次效应
摘要：不同的测序平台或同一平台不同样本得到的测序数据需要去除批次效应后进行整合分析，拟采用Seurat2程序包对CelSeq，CelSeq2，F...

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一文学会 | 采用Seurat3对10X Genomics示例数据进行单细胞测序数据分析
摘要：从https://s3-us-west-2.amazonaws.com/10x.files/samples/cell/pbmc3k/pbm...

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