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27篇文章 · 15718字 · 9人关注

RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同
RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同现在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, ...

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R语言如何用正则表达式提取特定的字符串
R语言如何用正则表达式提取特定的字符串原创徐洲更这个帖子是为了果子的一个提问 R语言能不能实现匹配括号里面的内容, 但是不包括括号这个问...

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GPL16686芯片平台分析
＃芯片分析中经常会遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前还没有现成的R包可以用，因此...

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转录组表达定量- Read count？CPM? RPKM? FPKM?
转录组表达定量- Read count？CPM? RPKM? FPKM? 1.Read count 数值概念：比对到某基因的reads数。用途...

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GPL17586、GPL19251和GPL16686平台芯片ID转换
原文载于生信技能树我写此文是为了致敬生信技能树团队！感谢他们无私分享！以下是生信技能树学员笔记投稿芯片分析中经常会遇到Affymetrix ...

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芯片的表达数据为负值？
芯片的表达数据为负值？隔离期间分析数据时发现有些芯片的数据的表达量归一化（未取对数）后还是负值；当时认为是芯片类型的问题，今天发现有人也遇到了...

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GSEA的分析汇总-转载
GSEA的分析汇总学习GSEA 生信技能树 GSEA的统计学原理试讲 GSEA GSEA这个java软件使用非常方便，只需要根据要求做好GCT...

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单细胞转录组数据分析的时候可以加上wgcna-转自生信技能树
单细胞转录组数据分析的时候可以加上wgcna 生信技能树 WGCNA分析大家都不陌生了，我在生信技能树多次写教程分享WGCNA的实战细节：一文...

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再也不用担心Excel基因名变成日期了
前一段时间处理数据发现Excel里面的差异基因有一部分变成日期了，直接想到了之前在生信技能树看到博文。现在转发出来。听说Excel表格动了你的...

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