6p21.31这种表示方式在人类遗传学中用得比较多。在参考基因组出来之前，人们通过做实验染色的方法将染色体染成很多段（就是那种很经典的黑白灰分段...

1. 如何选择参考基因组？——李恒2017年年底博客 1.1 三种选择 如果比对到GRCh37/hg19，使用： ftp://ftp-trace...

1. Gencode 官网：https://www.gencodegenes.org/ 1.1 The GENCODE Project: Enc...

上一篇写的是：重复一篇文献的GWAS（一）：基因型数据整理这一篇主要讲GWAS的核心流程和画图。 软件使用参考：使用GEMMA进行复杂性状全基因...

文献：A new regulator of seed size control in Arabidopsis identified by a g...

上个月中旬，出于对GWAS的好奇，我参加了一个培训班，之后又花了一周的时间来整理听课笔记，感觉现在对GWAS已经有了一个比较全面的认识。 在ca...

比如 个体分型率 < 90% 某一个样本测出来的标记小于全部标记的90% 标记分型率 < 90% 某一个标记只在小于90%的样本中存在 最小等位...

在学习基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing（基因定相、单倍体分型），主要是参考公众号碱基矿工中的一篇文章：人类基因组的Phasing原...

1.下机数据质量控制 主要是针对低质量的reads和含有adapter的reads，我事先并不知道adapter序列，所以就只过滤了低质量的re...