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ChIP/ATAC-seq资料
8篇文章 · 2485字 · 2人关注
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    【ChIP-seq】对Bam 文件添加chr

    参考： Question: Bam File: Change Chromosome Notation[https://www.biostars....

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    ATAC-seq 片段长度周期性分布图

    参考： 给你bam文件，你会画插入片段长度分布图吗？ 糗世界-ATAC-seq 「文献02」esATAC: 一个ATAC-seq分析的R包 【r...

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    ChIPseeker 饼图图层覆盖问题

    参考： 「r<-包|ggplot2|grid」ggplotify——连接各类R图形R神包export的使用 缘由; 最近使用ChIPseeker...

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    PFM-PWM-Seqlogo

    参考1：https://sites.google.com/site/zjuwhwsblog/blog/chip-seqshujudemotiff...

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  • ChIP 差异peak 脚本（DESeq2&DiffBind）

    ChIP-seq-analysisIn-depth-NGS-Data-Analysis-Course 以下使用DESeq2 & DiffBind...

    1.6 7997 4 11
  • ChIP-MACS2大批量运行+可视化代码

    当需要进行几百个peak calling 时候。对对应的treat,control bam写到macs2_input.txt文件中，就可以批量跑...

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  • ChIP随记

    ChIP-seq文献 1.【2018NB】phantompeakqualtools 1.MACS -g 表示实际可比对的基因组大小。比如说人类是...

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  • 【ChIP-seq】资源汇总

    source1: 表观遗传小白逆袭之道：从这 19 个视频开始吧！ 本系列视频涵盖表观遗传相关的细分领域：3D 基因组、DNA 甲基化及其动态调...

    0.8 1228 0 9

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