懒人只看这个图就好了。 benchmark 过程真的很精彩,建议通读一遍原文,附件更是有惊喜。 b: 第一行:Peak 分布的形状第二行:差异情...
个人观点:将 ignoreDownstream 和 ignoreUpstream 的结果取并集更好的能代表 TF 结合的靶基因启动子区??希望明...
链接来源 一切版权来源参考链接:此处只是用来记录和不能出去的情况。 Tutorial: Normalization of BigWig file...
数据导入:这里使用valr包自带的数据 导入前的数据格式为 写成函数, 计算区域内的信号值 通过函数计算genebody区的信号值,将其划分为2...
这里只考虑正向的,如果有反向的可以先转为正向。 从上图明显可以看出此信号明显的富集在TSS区右侧
https://f1000research.com/articles/6-1025/v1https://f1000research.com/ar...
https://f1000research.com/articles/6-1025/v1 放在最前面的valr包的说明书: https://cr...
https://github.com/dariober/SICERpy 14年发表 Spatial Clustering for Identif...
第1篇:ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同第2篇:原始数据的质控、比对和过滤第3篇:用MACS2软件call peaks第4...
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