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建立本地的可视化blast页面我们实验室主要是研究拟南芥的，因此要经常进tair网站，但是有时进的比较慢或者完全打不开，而NCBI也比较慢，所以我想建立一个本地的可视化的bl...
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gtf和gff转换的方法
使用cufflinks进行转换 但是这个有个局限性就是只能转换mRNA的gff文件，因为它识别的特征是exon，gene_id R::rtrac...
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sambamba的安装
下载文件 这个时候可能会报错 这是因为没有安装ldc这个库，那么就先来安装ldc这个库 然后再来安装sambamba
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augustus安装
安装之前，需要安装的软件：boost，samtools，bcftools，bamtools，docker，htslibgit clone htt...
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安装eugene的艰苦之路
wget http://eugene.toulouse.inra.fr/Downloads/eugene-4.2.tar.gz #下载eugen...
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genoplotR对基因组比较结果的展示先运行一段小的代码 一些数据格式的说明 dna_segs： （name，start，end，strand这四项是必须要的col，lty，lwd，...
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生信中可能要用到的软件的功能（不定期更新）
质控 fastqc，trimmomatic 比对 bowtie，bowtie2，bwa，STAR， 排序 samtools，picard 检测变...
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安装DESeq2时遇到的问题
在安装DESeq2时，有时因为xml和curl的问题安装不上去，解决方法是sudo apt-get install libcurl4-gnutl...
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