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融合基因和可变剪接融合基因 融合基因的分析也是转录组下游的一个分析，通常发生在染色体重排的情况下，导致距离相隔较远的的基因结合在一起，这种组合会造成基因失调和生成...
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DNA甲基化DNA甲基化是表观遗传学研究中的一个重要一个分支，符合表观遗传学DNA的序列信息没有改变的特地点，而是DNA的碱基发生了化学修饰。最常见的一种修...
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无参转录组序列组装 — Trinity转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类： 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装—定量—差异分析—功能富集分析...
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用「SAR」实时监控记录CPU，memory和I/O在做一些软硬件测评的工作，需要记录并统计每个流程中每一步所耗资源，如CPU, 内存和I/O。在某个公司分享的方法中，看到他们用「SAR」这个命令...
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计算位点的覆盖度和深度前面搜集了一些计算测序覆盖度和深度的方法，这次详细介绍下samtools如何解决了我的问题。 计算WGS/WES/panel捕获效率/覆盖度的方...
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计算WGS/WES/panel捕获效率/覆盖度的方法有哪些
WGS, WES, or targeted sequencing数据分析的时候，经常需要计算全基因组整体的平均测序深度或者 target 区域的...
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关于sentieon的几点补充说明sentieon的特点 sentieon是一款商业版call变异的软件。call变异的软件很多，为什么sentieon能商业化（据说价格还很贵）...
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MACS2文档学习文档链接：https://github.com/taoliu/MACS/MACS2是ChIP-Seq、ATAC-Seq、DNAsel-Seq等分...
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Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件之前分析过的测序数据，数据质量都很好，给了我一个错觉质控的前后差别不是很大，内心里对质控这一步也就不是很重视，跑完质控有时也懒得看结果，拿到一批...
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