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33篇文章 · 81298字 · 19人关注
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    富集分析圈圈图

    0.需求解读 这是富集分析比较常见的一个图,左图右表。 图的最外层是GOterm的编号,中间灰色背景层表示基因的logFC分布,可以看到每个te...

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    如何用Conda安装GATK?

    刘小泽写于2020.9.2现在conda的使用越来越方便,用的人也越来越多,就是因为学习成本简单,比较容易上手,并且不需要root权限以及修改b...

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    生信星球小练习—批量读取10X数据

    刘小泽写于2020.8.13主要分为两个部分:前面用linux处理,后面用R处理 下载数据 选用的10X测试数据是:https://www.nc...

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    会了GEO数据下载,来看看怎么上传吧

    刘小泽写于2020.8.12 1 注册NCBI GEO账号 先注册NCBI账号,在:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ...

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    R语言二十周年,Hadley Wickham访谈

    刘小泽写于2020.6.10在Medium看到有一个关于哈德雷的专访,分享给大家【老哈可是花花的偶像】如果你身边有朋友在学R语言,却不认识哈德雷...

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    横看成岭侧成峰,基因组文件有啥不同?

    刘小泽写于19.12.28我又回来啦!在马来西亚疯狂放松一周,体验了当地的风土人情。回来继续学习~感觉活力满满 这一篇的目的是:以果蝇为例,探索...

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    龙星计划第二天-关于alignment工具

    刘小泽写于19.7.30来北大的龙星计划做助教,接触了一些之前没有了解过的一些知识,简单做下记录,我个人其实是没有这方面需求的因为课程都是配置在...

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    一起来了解一下基因区间RangeData

    刘小泽写于19.3.30我们肯定都遇到许多利用坐标去处理范围信息的需求,比如要定位基因组的某个位置,这个位置可能代表了gene model 、g...

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    Pathway通路与GSEA基因集有何区别?

    刘小泽写于19.3.19通常做富集分析时,我们会遇到两种方法Pathway和GSEA,它们到底有什么区别? 前言 我们通过差异分析会得到一些差异...

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