Kraken和Kraken2(Kraken的迭代版本)是微生物组分析中最常用的软件,与其他同功能的软件相比,在速度快的前提下,准确性也很高。那么...
Kallisto下游推荐的分析软件是Sleuth,所以我们本次介绍如何使用Sleuth进行相关的分析。 RNA-seq在完成转录本的鉴定及定量后...
本文我们来简单介绍一下非常快捷好用的一个RNAseq工具——Kallisto。Kallisto被我推荐的原因是其速度非常快,在我的Mac Pro...
git 安装 git clone error Could not resolve host: socks5 解决方法:
NCBI中会将测序等数据压缩成sra格式。本文介绍如何批量下载sra文件及转化为Fastq格式。 下载SRA文件sratoolkit 从NCBI...
最近因为一些需求在研究TCGA数据库。关于TCGA数据库数据下载,随便搜搜就有很多文章,方法多样,可以通过R包也可以通过TCGA提供的官方下载器...
illumina下fastq文件命名 FASTQ文件在Illumina下通常会被命名为SampleName_S1_L001_R1_001.fas...
RPM/RPKM/FPKM/TPM是我们在定义表达量时常用的几种计算方式,那么究竟有什么区别呢? RPM/CPM RPM/CPM: Reads/...
视频实验期刊———Journal of Visualized Experiments (JoVE) 是一份展示可视化实验的期刊,是世界上第一个同...
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