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Short reads aligners-Thelearningnotesofthebiostarhandbook(8)map与alignment 新一代测序数据的处理过程中，map/alignment总是同时出现，那么二者的区别是什么呢？大致上可以这样理解：ma...
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BLAST-The learning notes of the biostar handbook(7)Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) 个用来比对生物序列的一级结构(如不同蛋白质的氨基酸序列或不同...
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k-mers和序列比对The learning notes of the biostar handbook(6)k-mers k-mers是指将序列分为k个碱基的字符串，一般长短为m的序列可以分成m-k+1个k-mers。ATGCA的所有k-mer如下：2...
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常见的数据格式及数据库The learning notes of the biostar handbook(4)常见的数据格式 genbank genbank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个记录代表了...
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基因本体论The learning notes of the biostar handbook(3)gene ontology 在早两个月前，按照班长的RNAseq教程，把整个流程模仿了一遍，最终得出很多差异表达的基因，可是这些基因（基因产物）...
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Linux常用的命令及初窥正则表达式--The learning notes of the biostar handbook(2)
Linux常用的命令 目录操作命令 ls 显示目录文件 ls -al-a 显示所有文件，包括.及..-l 详细信息-d 显示目录本身的信息，而不...
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生物学基础及环境准备--The learning notes of the biostar handbook(1)
万事开头难，从前都是碎片化的学习生信，一些基本的概念还是能粗略的理解，但知识始终无法结构化，更别说在公开的场合写下文字记录自己的学习心得。这次在...
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遇见生信
第一次接触到生物信息学可以追溯到读研究生那会。当时室友发表了一篇文章，大致内容是从GEO下载正常男性与不育男性精子的芯片数据，然后通过BRB_a...
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