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46篇文章 · 27663字 · 2人关注

推荐 | VCF2PCACluster快速实现超大规模SNP的PCA分析
推荐一个高效做PCA分析的工具，从VCF文件到直接出图的一键式分析，对于小白非常友好。小明哥刚开发时小编就在用了，那时还叫MingPCAClus...

0.7 718 0 1
pip安装PyVCF后有问题：ImportError: cannot import name 'Reader' from 'parser'
问题 Python通过pip安装PyVCF成功，但运行脚本时出现问题：解决使用conda重新安装： Ref：https://github.c...

3.0 252 0 1

关于Jupyter notebook无法自动跳转浏览器
这个问题网上已经有一堆回答了，如：解决Jupyter-notebook不自动跳转浏览器的详细方法[https://zhuanlan.zhihu...

3.3 4453 0 2
Centos安装Singularity记录
环境依赖 golang安装 Singularity安装直接在默认路径上编译会报错，显示Go没有找到，可是明明能运行go：删除整个singul...

3.5 1102 0 4
解决tabix建索引报错[E::hts_idx_push] Unsorted positions on sequence #
当我对两个基因型文件位置取交集，并重新生成两个vcf：出现如下错误：原因是位点未排序。因此可知bcftools从vcf取位点子集时，并不会对...

0.7 1631 0 1
Xshell5+Xftp5永久安装与使用（不自动更新）
Xshell是我用过最好的终端访问服务器的软件，搭配Xftp文件传输，体验很好。不过6及以后版本就收费了，虽然对于学校和家庭使用可以免费，但每次...

0.7 4379 0 1
Admixture只能用整数染色体: "Invalid chromosome code. Use integers!"
原始帖 Admixture做群体结构分析是好用，但也有一些不顺手的地方。最大的问题是不支持非整数的染色体号！相信我们手里绝大部分vcf或pli...

3.5 1674 0 2

vscode 通过ssh远程连接多台服务器？
需求想要把在linux终端操作的习惯改到本机上来。理由如下： linux下的vim对于编程调试不是很方便；编程与命令不能很好链接，经常要多开...

6.3 4689 0 20
使用transanno制作不同基因组版本坐标映射的chain 文件？
不同基因组版本的位置（坐标）对应关系，在数据分析环节经常用到。位置对应关系通常通过比对来获取，而信息一般存储在chain文件中[https:/...

5.2 2149 5 4