cellranger更新到6.0啦（全新使用教程）[https://www.jianshu.com/p/5dca72a194b3]CellRan...
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cellranger 6.0
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单细胞10X代码学习1.VlnPlot 2.过滤 矩阵随机抽样 求比例 求每个基因在细胞中的比例 top50高表达的基因 挑选颜色 多个图放一张 多个分辨率之间关系...
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cellranger实战2：非正常数据之仅有bam文件我所理解的cellranger软件理想原始输入数据就是SRA格式，然后利用sra-tools分为read、barcode+UMI、index三个...
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（一文读懂scRNA-Seq）到底要花多久时间才能看懂一套单细胞测序数据结果？先说我的态度。 最快的捷径就是没有捷径，踏踏实实搞学问 我一直相信慢工出细活（当然我写推文都不怎么想回头检查错别字），要学习什么东西，稳扎稳打才...
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【单细胞转录组 实战】二、上游分析SMART-SEQ2特点：基因数量还行，细胞数量不太多。 这里是佳奥！让我们开始吧！ 从下载文章数据开始。SRA是测序数据下载，Suppleme...
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【单细胞转录组 实战】一、背景知识这里是佳奥！终于到了单细胞篇章，这将会是一个很长的系列，先前我们学习了R，shell脚本以及转录组分析，有了这些基础我们开始单细胞转录组的学习。...
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CellRanger原理0. 概述 Cell Ranger 是 10X genomics 官方提供的一套针对单细胞 RNA 测序输出结果进行比对、定量、聚类及基因表达分...
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比对软件STAR的使用
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。S...
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单细胞分析---拟南芥例子初体验因为我是主要做植物的，所以先找了个拟南芥的例子（A single-cell RNA sequencing profiles the develo...
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单细胞分析seurat包学习笔记1本文参考Satija Lab的seurat 包，网址https://satijalab.org/seurat 设置Seurat对象 在本教程中，...
专题公告
单细胞测序
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