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小麦研究
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    【每周文献】miRNA调节NBS-LRR-2012 Plant Cell

    miRNA482 target到NBS-LRR基因上，导致NBS-LRR mRNA被切割，并形成secondary siRNA。这些second...

    1.0 曹务强 0 5
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    R包——maftools 可视化神器

    背景介绍 随着癌症基因组学的进步，突变注释格式（MAF）被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变体。 癌症基因组图谱项目对30多种不同的癌症进行了测...

    4.7 oddxix 1 61
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    使用salmon和sleuth进行小麦RNA-seq差异表达分析

    blast大家一定熟悉吧, 最近有大神爆出一个bug。也即参数“-max_target_seqs”并不是你理解的那样。下图红色箭头处是NCBI上...

    0.2 Neal_Bio 9 12
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    小麦jbrowse数据更新

    正式开始之前，说一点最近刷屏的假疫苗事件。2016年4月份济南发生疫苗质量安全事件，当时我们的总理做过批示，要严肃彻查处理，绝不姑息。这次又看到...

    0.2 Neal_Bio 3 4
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    “小麦研究联盟”文章汇总

    我将过去一年的所有推送做了一个汇总，并大致分成了几类。现在回过头来一看，这算是一份很宝贵的材料，特别是对刚刚入学的新生来说。资料一多，查找就不方...

    0.3 Neal_Bio 0 10
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    一篇赤霉病关联分析的文章

    昨天Neal发的匆忙，没有好好介绍那个fasta小工具。如果以后有什么fasta格式的序列要转换格式，统计信息，fasta文件切割，CDS批量翻...

    Neal_Bio 0 0
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    一篇小麦基因家族研究的文章

    昨天nature上出了一篇关于小麦三代测序那篇文章的新闻报道，报道的题目是“Small group scoops international e...

    Neal_Bio 0 0
  • call SNP from wheat RNA_seq

    首先输入文件格式如下下图。 代码如下，这个流程是根据sentieon提供的流程稍加改动而来，这里不再对每一步进行解释，请见谅，另外注意参考基因组...

    Neal_Bio 0 1
  • call variations from wheat DNA_seq

    文件格式是如下，就是SRA编号，一行一个SRA。fastq文件是在ncbi上下载的SRA格式。小麦基因组单条染色体往往大于500Mb，所以要使用...

    Neal_Bio 0 0
  • 由QTL到基因--到底该不该高兴呢？

    由QTL到基因--到底该不该高兴呢？ 同源克隆的话题我们讨论了不少（ 原文中此处为链接，暂不支持采集 原文中此处为链接，暂不支持采集 原文中此处...

    Neal_Bio 0 3

专题公告

本专题收录一切与小麦研究有关的文字、摄影等