参考：https://www.omicsclass.com/question/705 首次用hmmsearch对我的蛋白质进行结构域搜索，最终只...
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【生信】HMMER：hmmbuild自建hmm文件 -
hmmsearch的报错方案小试最近又重新做起了进化，这里就记录一下的在这个过程中遇到的问题吧~这里转述一下师弟的提问： 报错情景：hmmer / hmmsearch，在使用p...
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Lunix运行脚本、任务（sh、nohup、qsub）
1 sh 产生日志： sh **.sh &> xx.log 不产生日志： sh **.sh > /dev/null 2>&1 & 2 nohup...
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SGE作业调度系统的简单理解
Sun网格引擎（Sun Grid, SGE）是一种来自于 SUN Microsystem的分布式资源管理和调度系统，它用来在基于UNIX的计算环...
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SNPs calling流程（GATK4）
SNPs marker是全基因组范围应用广泛的分子标记，本文介绍生态基因组学中利用GATK4软件进行SNPs calling的流程（人的研究中可...
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piRNA reads数分析
##### -a 输出所有multipy alignment #### bowtie2 -p 18 -a -x /media/pc/disk2/...
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做piRNA gff文件
#从miRBase下载miRNA的注释信息 #从piRNAbank下载mouse_pir.txt #将mouse_pir.txt转换成gtf注释...
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sam和bam格式文件的shell小练习前期准备: 统计共多少条reads(pair-end reads这里算一条)参与了比对参考基因组 统计共有多少种比对的类型(即第二列数值有多少种...
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IGV的使用IGV需要的文件：比对文件为 bam和bam.bai文件 参考基因组文件为 .fa文件 比对文件...
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通过VCF文件制作定制化的参考基因组
前言 最近做的项目要对reference genome基于突变进行一些modify，制作personalized genome或者说是psued...
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