公众号原文点我[https://mp.weixin.qq.com/s/sVWseQoyxL5tEM5PDf-iuQ] Part 1 ：气泡图 气...
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一起学画图：气泡图—常用于富集分析
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建细菌进化树的策略前面写了16S rDNA进化树[https://www.jianshu.com/p/1738195eb1aa]。关于细菌基因组水平，下面记录这篇...
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mcmctree估算物种分歧时间基因序列中的密码子随着时间的推移以几乎恒定的比例进行替换，具有恒定的演化速率，因此两个物种时间的遗传距离与物种分歧时间成正比。 本文就利用mcm...
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MCMCTree 分析中的时间单位问题——100百万年
先见教程：http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/MCMCtree.Tutorials.pdf[http:/...
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超级爽！~精细比较近源物种 / 单倍型 / 基因组的神器！写在前面 三年前，那时往“全国植物基因组会议”投个了摘要，也准备了下墙报，有点期待能得到点认可。当然和以前一样，优秀跟我没啥关系。这是结果，结果...
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基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（下）最近刚返校，事情比较多，每天也很忙，之前写的《基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上）》也一直没来得及更新，缺少cafe输出结果的解读及后面...
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基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上）一、数据准备 首先，选取不同物种的Protein数据集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Di...
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OrthoFinder比较基因组确定基因家族简介OrthoFinder是用于比较基因组学的快速，准确和全面的平台。 它查找直系群和直系同源物，推断所有直系群的根源基因树，并识别这些基因树中...
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Orthofinder运行结果文件解读OrthoFinder结果文件 运行标准OrthoFinder会产生一系列文件：直系同源组、直系同源、基因树、物种树、基因复制事件、比较基因组学...
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生信基因功能分析工具：Orthofinder使用教程
最近Orthofinder2开始陆续更新，文章已经投发到biorkix上，在网上搜了一圈，关于Orthofinder的使用的中文教程几乎是空白的...
专题公告
OthFinder、CAFE等分析流程
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