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RNA Seq流程
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  • RNA-seq分析至尊套餐

    本分析从HISAT2比对的counts开始，先整合所有的counts数据，再获取再半数以上样本中CPM>1的基因，再进行差异分析，pathway...

    0.5 落寞的橙子 3 3
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    SRA 数据下载自救指南

    还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的不行？这里有一个SRA 下载自...

    3.3 思考问题的熊 25 58 1
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    biostarhandbook|你真的懂mRNA-seq数据分析了嘛?

    mRNA-seq是目前最常用的高通量测序技术，一般的用法就是看看基因表达谱，寻找差异表达的基因。我和高通量测序数据分析结缘，也是因为RNA-se...

    0.2 xuzhougeng 1 20
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    转录组练习（3）

    原文地址：https://www.jianshu.com/p/1174a53abe7d 作业要求 需要用安装好的sratoolkit把sra文件...

    苏慕晨枫 0 0
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    RNA-seq流程各阶段软件的最优选择

    RNA-seq如今已经成了最受宠爱的生信分析了，而如今琳琅满目的各种生信软件摆在具有新时代选择困难症的同学们眼前我们又犯难了。我们该选择哪套流程...

    0.5 sober01 0 31
  • h38构建索引

    先下载h38的参考基因组文件 一般情况下只要执行以下命令即可： 但是，我这里要提取各条染色体排序。 好了，构建完毕。 重点：samtools d...

    线断木偶人 0 0
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    RNA-seq完整分析过程

    linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是...

    12.9 热衷组培的二货潜 28 210
  • 转录组学习一（软件安装）

    转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gtf注释探究） 转录组学习五（...

    2.3 Dawn_WangTP 1 57
  • RNA-seq分析文章结果重现

    文章：Temporal dynamics of gene expression and histone marks at the Arabido...

    0.4 Dawn_WangTP 0 14
  • RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具

    写在前面: 来自生信技能树《生信必修课之软件安装》学会用包管理工具安装软件 普通安装和配置，请看这篇Linux下bowtie2安装(非conda...

    2.8 Y大宽 1 54

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