细胞时空分化轨迹是指在个体发育过程中，细胞在不同时间和空间条件下的分化过程。细胞分化的轨迹推断，能够为研究组织发育、疾病进展提供重要见解。由于细...

由于空间分辨率有限且依赖单细胞参考数据，在空间转录组学 (ST) 中解析组织区室仍然具有挑战性。2024年11月，《Communications...

细胞分割和分类是空间组学数据分析中的关键任务。2024年11月，《Nature Methods》发表了一种端到端的模型——CelloType，专...

单细胞多组学技术的发展极大地增强了我们对生物学的理解，与此同时，许多算法已被提出来从单细胞转录组信息中预测细胞的蛋白质丰度和/或染色质可及性，并...

结构变异(SVs)对人类基因组多样性有重要贡献，在精准医学中起着至关重要的作用。尽管单分子长读长测序技术的进步为SV检测提供了突破性的资源，但准...

为癌症患者量身定制最佳治疗方案仍是一项重大挑战。为解决这个问题，相关研究团队开发了一个肿瘤精准治疗计算框架——PERCEPTION（PERson...

单细胞Hi-C (scHi-C) 技术的出现为研究细胞周期阶段与染色质三维 (3D) 结构之间的复杂关系提供了前所未有的机会。然而，基于 scH...

现有的时空组对齐和整合方法由于耗时极长且准确度不理想，不适用于处理大规模、基于图像的空间组学数据集。2024年7月，《Nature Commun...

细胞间通讯（CCC）的推断对于更好地理解生物系统中复杂的细胞动力学和调控机制至关重要。然而，在单细胞分辨率下准确推断空间CCC仍然是一个重大挑战...

近日，由山东第一医科大学附属省立医院（山东省立医院）“内分泌糖脂代谢与脑老化”教育部重点实验室、复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室、华大...