空间转录组技术生成具有空间背景的基因表达谱，需要空间信息分析工具来完成三个关键任务：空间聚类、多样本整合和细胞类型去卷积。近日，《Nature ...

有效降维对于scRNA-seq分析至关重要。主成分分析（PCA）被广泛使用，但需要连续的、正态分布的数据；因此，它经常与scRNA-seq应用中...

批量测序实验（单组学和多组学）对于探索广泛的生物学问题至关重要。为了促进交互式、探索性任务以及共享易于访问的信息，《Briefings in B...

空间转录组学研究正在达到单细胞空间分辨率，数据通常来自多个组织切片。《Genome biology》发表了一种计算方法BASS，支持单细胞分辨率...

量化肿瘤微环境（TME）中各种细胞类型之间和内部的串扰，有助于开发用于肿瘤靶向治疗的工具。《Briefings in Bioinformatic...

2022年10月《Nature Biotechnology》发表了一篇空间转录组（ST）技术的综述文章，详细描述了现有的ST技术及其发展方向。 ...

近日，中国科学院院士、陆军军医大学第一附属医院病理科主任卞修武院士，以色列魏茨曼科学研究院Ido AMIT教授联合华大生命科学研究院徐讯研究员及...

2022年10月29日，由深圳国家基因库和深圳华大生命科学研究院共同研发的时空组学数据库V1.0版本（STOmicsDB）在国家基因库生命大数据...

空间分辨转录组分析可以揭示组织结构和环境依赖性细胞-细胞或细胞-环境相互作用的分子机制。由于目前的技术限制，以单细胞分辨率获得全基因组空间转录组...

分析空间转录组数据集的一个主要挑战是同时合并细胞转录组相似性及其空间位置。近日《Nature Communications》发表了一个灵活的深度...