来自不同物种的单细胞基因表达数据集越来越多，这为探索跨物种细胞类型之间的进化关系创造了机会。scRNA-seq数据的跨物种整合尤其具有参考价值。...

空间转录组学 (ST) 技术使研究人员能够研究转录组在组织中的空间分布，然而联合分析多个ST切片并对齐它们以构建组织的三维（3D）结构仍然是一项...

单细胞多组学技术为阐明单个细胞的基因组、表观基因组和转录组异质性的特征提供了见解。然而，它们给数据处理带来了新的计算挑战。2023年10月，《B...

空间分辨组学技术揭示了不同生物系统中细胞的空间组织。2023年11月，《Nature Communications》发表了一种基于图的算法——S...

准确识别空间域对于下游分析至关重要，虽然越来越多的计算方法被开发用于空间域检测，但大多数方法无法自适应地学习基因表达和空间信息之间的复杂关系，导...

2023年11月11日，由深圳国家基因库和华大生命科学研究院共同研发的时空组学数据库（STOmicsDB）在国际学术期刊《Nucleic Aci...

细胞间相互作用（CCIs）在细胞分化、组织稳态和免疫反应等许多生物过程中发挥着关键作用。随着scRNA-seq技术的快速发展，从不断增加的scR...

《Briefings in Bioinformatics》发表了一种新的scATAC-seq数据注释工具——AtacAnnoR，使用注释良好的s...

表征肿瘤微环境（TME）中的代谢重编程在癌症研究和治疗中具有重要意义。近日，《Nature Communications》发表了一个计算框架——...

最近出现的多样本多条件单细胞多队列研究使研究人员能够研究不同的细胞状态。近日，《Nature Communications》发表了一种可扩展的算...