1.改脚本 intron.gff文件需要改 读取intron的部分 原来使用的intron： gff处理： 使用之前detabase里的intr...
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2020-11-25 -
取只在intron的序列可以先使用intron做参考基因组比对再取。看一下结果 如果用取sam的方式，同一条序列只要看左右有没有超出intron位置即可。 这样可以使用...
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根据GFF3文件统计外显子大小和数量以及内含子大小
每个基因的外显子起始与结束的位置，保存为1.txt,注意需要打开1.txt编辑删除第一行的空行 计算每个外显子的大小 计算每个内含子的大小 统计...
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「生信练习题」调整GFF文件中的坐标位置
已知，我们通过seqkit faidx ref.fa chr8:25234310-25266151 > target.fa提取基因组上的一个片段...
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如何提取一个基因组中所有intron
最近有个任务需要从基因组中提取所有的内含子（intron）区域。一开始觉得很简单，用ensembl上的biomart或者ucsc genome ...
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