在之前的步骤中，已经筛选出感兴趣的转录本信息，并添加了多种注释了。接下来就可以做最后的分析了，比如哪个基因的转录本信息变化最大，如何变化。由于之...
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RNA-seq学习：No.8IsoformSwitchAnalyzeR包（2） -
RNA-seq学习：No.7IsoformSwitchAnalyzeR包（1）IsoformSwitchAnalyzeR包是2019年才发布的一个分析包，更充分地发挥了RNA-seq数据的价值。学习笔记参考官方文档，示例文...
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RNA-seq学习：No.6富集分析--GESA如前所说，过表达富集分析有不少缺点。因此以GSEA为代表的FCS方法也是人们所倾向的选择。接下来将简单了解下方法原理，并利用差异分析数据实操一遍...
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RNA-seq学习：No.5富集分析--ORF过表达1、基础知识 （1）基本概念 富集分析(enrichment analysis)简单来说就是将成百上千个基因、蛋白或者其他分子分到不同的类中，以...
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RNA-seq学习：No.4下游分析之DEseq2包差异分析基于上游分析获得表达矩阵后，就可以进行差异分析了，最基础的莫过于利用DEseq2包寻找差异基因。学习自b站视频生信技能树转录组视频~ 0、数据准...
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RNA-seq学习：No.3上游分析获取表达矩阵
RNA-seq的上游分析主要基于Linux平台，根据给定的fastq文件，经过系列生信软件处理最终得到表达矩阵的过程。原始数据文件一般可以从文献...
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RNA-seq学习：No.2测序基础知识本次学习主要基于生信星球的文章测序的世界[https://www.jianshu.com/p/101c14c3a1d2]，站在巨人的肩膀上学知识...
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RNA-seq学习：No.1什么是RNA-seq？RNA-seq即转录组测序技术，就是把mRNA，smallRNA等用高通量测序技术把它们的序列测出来，反映出它们的表达水平。 mRNA：信使me...
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