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  • 简书笔记汇总

    以下是我简书里所有的文章链接，按不同的专题分类，方便大家根据不同专题以及文章题目快速的查看所需内容。 持续更新中~ Linux学习笔记 《Lin...

    14.1 生信start_site 6 139
  • TCGA 数据分析实战 —— 干性指数（mRNAsi、mDNAsi）

    前言 干细胞(stem cells, SC)是人体内具有自我复制和多向分化潜能的原始细胞，而这种自我更新和分化为成熟细胞的能力称为干性 肿瘤干细...

    1.8 名本无名 14 24
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    RNA-seq 分析流程 —— 概述

    前言 接下来我们要介绍的是 RNA-seq 数据的处理分析流程，根据 RNA-seq 测序技术的不同，可以分为三种： short-read lo...

    3.9 名本无名 0 63
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    TCGA 数据分析实战 —— 差异甲基化区域模体分析

    前言 DNA 甲基化在许多细胞进程中扮演重要的角色，例如胚胎发育、基因印迹、X 染色体失活和维持染色体稳定性。 在哺乳动物中，DNA 甲基化很少...

    3.8 名本无名 5 29
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    转录组分析中的免疫浸润的评估方法

    注：本文仅讨论转录组数据中的免疫浸润评估。关于免疫浸润的计算，其实有不少综述进行过总结。笔者看到过2篇发表于2018年的相关综述（虽然现在都20...

    0.6 Bio_Learner 0 10
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    记不住PD1、PD-L1？

    当对一个item非常陌生且怎么也都记不住的时候该怎么办？我有一个办法，就是看科普视频，从画面、声音等多个角度让我快速记住新概念，这个办法屡试不爽...

    1.5 冻春卷 4 9
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    MSI 检测方法概述

    1 MSI 相关概念 微卫星（Microsatellite）序列是遍布于人类基因组上数百万个基因座（loci）中的短串联重复（short tan...

    3.6 名本无名 0 9
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    基因突变类型分类

    写在前面的话： 基因突变，指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。突变可以发生于编码序列，也可发生在启动子、内含子和剪切位点等非编码序列。...

    2.7 静小沐 0 25
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    reads计数原理及featureCounts统计counts后的cpm和tpm计算

    摘录：生信技能树论坛 Kai statquest 要求：实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-cou...

    0.8 vicLeo 0 16
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    Chip-seq学习记录

    关于概念问题，很重要 第1篇：ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同https://mp.weixin.qq.com/s/gLc...

    2.9 小梦游仙境 2 27