继续Linux基础的教程，该教程内容是安装生信分析软件。 1.8 生信软件的安装 有root权限（可以使用yum或apt-get命令安装） （推...
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转录组上游分析教程 | 第一章 生信软件的安装 -
RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程
今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分...
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Fastp:质控 +过滤数据
常规的质控和过滤数据是fastqc+trimmomatic，据说fastp更快，而且一次完成质控过滤和出图。fastp的githubfastp的...
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fastp全新的数据质控软件各位做生信的小伙伴都知道，对于下机的FASTQ数据需要进行质控和预处理，以保证下游分析输入的数据都是干净可靠的。通常我们都是使用FASTQC等软...
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fastp：数据质控 + 过滤
之前都是用 fastqc+trimmomatic进行数据质控和过滤，但是fastp更方便也更快，而且可以一次完成质控过滤和出图。 1. Fast...
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CBNplot：揭示富集分析中各通路的调控关系说在前面 Immugent在之前一篇推文中：CBNplot：可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp.weixin.qq.com/s...
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RNA-seq入门（三）比对、输出表达矩阵一、hisat2进行转录组比对 1. 首先下载参考基因组 在NCBI,UCSC和Ensemble数据库都可以下载到参考基因组，这里下载UCSC的...
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【RNA-Seq 实战】四、序列比对这里是佳奥，让我们继续转录组分析的学习！ 常用的软件：hisat2、subjunc、star、bwa、bowtie2（主要针对基因组）等 1 s...
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CBNplot：可视化富集通路中基因的调控关系说在前面 相信大家在平时做富集分析时都会有这样的一个需求：如果能知道感兴趣的某条通路中各基因的调控关系，那么就能准确识别出hub基因；或者说找到...
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Bulk RNA-Seq 差异表达分析流程以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章，现在整理为流程，同时修改一些错误。流程包含质控、比对、定量、差异分析。 前处理 拿到原始 fast...
专题公告
转录组分析
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