一组对照加处理这种实验的差异表达分析结果通常是用火山图来展示，如果是很多组实验的话如何展示，这种情况我之前还没有遇到过。公众号后台有读者留言问到...

写在前面 一个师妹在分析一套数据，比较了agriGO和TBtools的富集结果...发现了两者有挺大的差异，如下 AgriGO TBtools ...

写在前面 约莫一个月前，不知为何，突然收到好几个朋友问了一些TBtools的使用问题。按照我个人的设想，TBtools的使用应该不会存在使用问题...

RNAseq常规做法是先筛选出差异表达基因，然后针对筛选出来的差异基因做GO富集分析。 1.水稻、小麦GO信息提取 在进行GO富集分析前首先要确...

设置生物学重复这个环节也是你实验设计很重要的一part，设置的好对你下游分析也有利，通常我们做转录组测序，需要的样本量每组至少为3个生物学重复，...

GATK官方给出了从RNA-seq数据中寻找变异位点的流程，但这个示意图比较简洁，实际操作时一不小心就会报错，故经过探索，记录下这个流程的细节以...

这本是三年多之前我发在公众号上的一篇旧文，一些偶然的机会，发现不少朋友也在讨论这个问题，因此我重新做了梳理并发出来。这样的讨论是有益的，放在今天...

通过前期的基因定量，我们通过**RSEM**或者Kallisto这些工具得到了每个基因或者转录本的表达量矩阵。输出的矩阵包含了基因以及在各个样本...