在STRING数据库中提交基因,获取PPI网络是比较常规的操作,包括下游使用cytoscape进行美化和hub网络的提取,但过程还是比较麻烦,本...
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说在前面 Immugent在之前一篇推文中:CBNplot:可视化富集通路中基因的调控关系[https://mp.weixin.qq.com/s...
本节概览:1.获取DEG结果的上下调差异基因2.bitr()函数转化基因名为entrez ID3.利用clusterProfiler进行KEGG...
有了R语言的基础,以及ggplot2绘图基础,我们的生信常用分析图形的绘制就可以提上日程了!本系列,师兄就开始带着大家一起学习如何用R语言绘制我...
前面小编给大家分享了几个科研中经常用到的基因集,以及如何使用这些基因集进行相关分析。 ☞ m6A甲基化相关基因集[https://link.zh...
GEO数据库对应的R包是GEOquery,强大的ArrayExpress数据库也有对应的R包——ArrayExpress。可以通过其访问Arra...
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前言 NCBI Gene Expression Omnibus(基因表达综合数据库,GEO)公开了很多高通量基因组学数据集。尽管名字很好听,但这...
单细胞分析不可避免的会涉及到鉴定不同细胞类型的功能或比较相同类型在不同状态下的功能差异,因此,功能分析在单细胞分析中相当重要. 功能分析的方法很...
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