概念回顾 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化...
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Fst的计算原理与实战
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把基因画在染色体上之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggpl...
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下载SRR文件的aspera和prefetch方法参考用list批量下载SRR数据的方法 https://www.jianshu.com/p/f16ed4c79739 1.aspera安装asp...
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bamtofastq 将bam文件转成fastq文件目标 通常比对好的bam，如果需要重新比对，需要将文件转成原始的测序文件的格式fastq。通过bedtools中的bamtofastq 能够将文...
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pyclone的输入格式：通过GenomicRanges准备输入
问题： 在准备pyclone的输入的时候，需要点突变和对应的拷贝数信息。点突变的信息可以通过varscan获得，而拷贝数的信息可以通过seque...
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解析ABSOLUTE软件
简介ABSOLUTE ABSOLUTE是Broad研究所开发的一款癌症CNV分析软件，实质是一个R包，可以定量细胞的绝对拷贝数、肿瘤纯度与倍性，...
专题公告
肿瘤基因组学相关的工具以及文献
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