SCEVANA fast variational algorithm to detect the clonal copy number subs...
投稿
收录了6篇文章 · 4人关注
-
论文日鉴19--鉴别单细胞肿瘤和非肿瘤 -
Fst的计算原理与实战
概念回顾 Fst：群体间遗传分化指数，是种群分化和遗传距离的一种衡量方法，分化指数越大，差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。 用于衡量种群分化...
-
把基因画在染色体上之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggpl...
-
下载SRR文件的aspera和prefetch方法参考用list批量下载SRR数据的方法 https://www.jianshu.com/p/f16ed4c79739 1.aspera安装asp...
-
bamtofastq 将bam文件转成fastq文件目标 通常比对好的bam，如果需要重新比对，需要将文件转成原始的测序文件的格式fastq。通过bedtools中的bamtofastq 能够将文...
-
pyclone的输入格式：通过GenomicRanges准备输入
问题： 在准备pyclone的输入的时候，需要点突变和对应的拷贝数信息。点突变的信息可以通过varscan获得，而拷贝数的信息可以通过seque...
-
解析ABSOLUTE软件
简介ABSOLUTE ABSOLUTE是Broad研究所开发的一款癌症CNV分析软件，实质是一个R包，可以定量细胞的绝对拷贝数、肿瘤纯度与倍性，...
专题公告
肿瘤基因组学相关的工具以及文献
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1900911/cancer-genomics.jpg', '推荐专题《肿瘤基因组学》（ 分享自 @简书 ）','https://jianshuapi.com/c/c2980fe9461d?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}