背景 双亲高度杂合（亲本由多个单体型构成）的分离群体利用常规的BSA分析方法往往结果并不理想，因为在混池中有多等位基因的干扰。OcBSA就通过解...
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BSA分析（八）——OcBSA -
BSA分析（六）——QTLseqr包前言 我在犹豫是否补充一篇怎样拆分染色体进行比对和变异检测（主要是为了提高比对和变异检测效率）的帖子。开始没有规划这篇内容的原因有两点：一是内容...
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BSA分析（七）——DeepBSA本篇内容根据官方说明文档撰写，软件操作十分简单，所以内容不再特别详细的介绍。 DeepBSA是一种用于解析复杂性状的创新Bulked Segre...
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BSA分析（五）——变异检测及样本合并
本文中vcf文件的获取主要是使用gatk的HaplotypeCaller模块，该模块的原理大概如下： 定义active regions 沿着参考...
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BSA分析（四）——序列比对及比对信息统计
拿到质控后的数据就可以开始进行数据的比对了。（这里复习一下）需要确定好参考基因组，参考基因组选择标准：质量高、完整、和某一亲本相近（是亲本之一的...
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BSA分析（三）——测序数据的质控关键词：BSA分析，测序数据质控，FastQC，Trimmomatic，去接头序列 数据格式 一定要先搞清楚数据的格式，才能进行进一步的数据整理...
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BSA分析（二）——分析准备工作关键词：BSA分析，群体构建，性状选择，测序数据性状选择、群体构建、测序数据以及参考基因组是BSA分析结果成功的关键。所以在准备进行BSA分析之...
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BSA分析（一）——原理及发展史背景及原理 BSA（Bulk Segregation Analysis）最早是由Michelmore等人（Michelmore et al., ...
专题公告
该专题主要分享BSA分析的发展，常见分析群体，包含常见算法的分析软件的下载使用，分析注意事项等等相关知识
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