文章流程 下载VarScan方法的TCGA的maf突变格式文件 计算突变基因，寻找至少在15个样本都存在突变的基因 构建突变基因的PPI网络 突...
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SNP mutation‐related genes in breast cancer for monitoring and prognosis of patients: A study ba... -
分子进化树构建及数据分析方法介绍【转】
首先是方法的选择。基于距离的方法有UPGMA、ME（Minimum Evolution，最小进化法）和NJ（Neighbor-Joining，邻...
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关于SNP
网址：https://www.ebi.ac.uk/sites/ebi.ac.uk/files/content.ebi.ac.uk/materia...
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SNP数据构建系统进化树大概是长期的不锻炼使得今天的爬山运动过量了，接着悲剧就是无法入眠。也幸亏明天是周日，干脆就起床码字了。总结下自己前面用snp构建系统进化树的方法...
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SNP连锁不平衡图（LD）可视化R包LDheatmap的使用理解SNPs之间的联系或连锁不平衡（LD）模式对于单体型的选择具有重要作用，然而，对于密集的SNP图谱，随着区域内SNPs数量的增加，很难直接从...
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SNP(Single Nucleotide Polymorphism)
Recently, I’m studying Genetics and there is an important concept called...
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GATK4.0找SNP
####下载GRCm38 snp和indel vcf文件 #### ftp://ftp-mouse.sanger.ac.uk/REL-1303-...
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一步一步学会撰写SNP Calling 流程（二）3.1 DNASeq 数据分析SNP/Indel 策略 策略一： BWA + Samtools /Picard + GATK 1) BWA 比对...
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SNP位点寻找流程——傻瓜版
本人通过无数个网上文章的指导，无数个萝卜的坑，终于摸索出了一整套完整的、傻瓜式的寻找全基因组的SNP实操流程。 仅以此文纪念我这俩个月的努力。 ...
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关于SNP的过滤（1）：如何使用vcftools进行SNP过滤
前言 很多关注我这个专题的朋友都在后台留言，说想了解更多关于SNP过滤的东西。是的，确实这是一个比较重要的问题。第一，过滤到一些低质量的SNP可...
专题公告
了解常用的分子标记及其应用！
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