KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库),可以获得KE...
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KEGG pathway 注释整理 获得KEGG注释 通过eggnog-mapper和interproscan两个软件(或数据库),可以获得KE...
使用KAAS做KEGG注释 标签: KEGG, RNAseq, bioinformatics 什么是KEGG 中文名: 京都基因与基因组百科全书...
在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天为大家介...
基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测,根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对,完成功能注释。常用数据库一共有以...
首先下载COG functional categories代码对应的功能描述信息 fun2003-2014.tab,文件位于COGS数据库中。 ...
这两天在基因课上学了一下eggnog-mapper,先看文章,然后看视频课程,正好工作有需要对一批转录本进行功能注释。捣鼓一下,在基因课的服务器...
eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因,常见的方法就是BLA...