单细胞系列教程目录索引,持续更新...[https://www.jianshu.com/p/98fc6c80c216] 参考文献：Single-...
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肿瘤样本中的正常上皮鉴定-参考Nature Communications -
单细胞测序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高级分析、文章复现
时代的洪流奔涌而至，单细胞技术也从旧时王谢堂前燕，飞入寻常百姓家。雪崩的时候，没有一片雪花是无辜的，你我也从素不相识，到被一起卷入单细胞天地。R...
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04.单细胞亚群注释
根据前述教程，我们已经完成了Seurat对象的构建-质控-降维-聚类。最终得到了细胞的分群如下： 那么接下来我们就要对得到的分群进行细胞类型的注...
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02.认识Seurat对象关于Seurat对象的构建请参考：01.单细胞入门-Seurat对象创建[https://www.jianshu.com/p/fc2f29db9...
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单细胞数据处理小细节汇总1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后，矩阵默认会变成SCT矩阵，如果不加设置，后续的PCA等操作都是...
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单细胞之富集分析-5：一张图展示多组富集分析结果单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c...
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单细胞亚群差异基因火山图单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优...
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01.单细胞入门-Seurat对象创建单细胞测序下游原始文件主要以三种形式在GEO存储 针对三种不同的存储形式分别对应不同的seurat对象创建方式 1.以标准的barcodes.t...
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01.infercnv-区分肿瘤样本中的正常上皮细胞-infercnv运行参考文献Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Ce...
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02.infercnv-区分肿瘤样本中的正常上皮细胞-infercnv结果处理
关于infercnv的输入文件整理和运行参数参考01.infercnv-区分肿瘤样本中的正常上皮细胞-infercnv运行[https://ww...
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