GATK官方给出了从RNA-seq数据中寻找变异位点的流程，但这个示意图比较简洁，实际操作时一不小心就会报错，故经过探索，记录下这个流程的细节以...
投稿
收录了4篇文章 · 1人关注
-
使用GATK从RNA-seq数据中call variants -
bwa bowtie2 salmon subread hisat2建索引和比对bwa bowtie salmon 直接从fastq到达特异性表达矩阵 subread 备注：需要对应建索引的软件版本，版本不同会报错！ his...
-
RNA-seq(1) :用conda安装RNA-seq所需要的工具
写在前面: 来自生信技能树《生信必修课之软件安装》学会用包管理工具安装软件 普通安装和配置，请看这篇Linux下bowtie2安装(非conda...
-
一个植物转录组项目的实战（转载）其实这个植物是拟南芥，所以跟人类研究的数据处理大同小异。 转录组 转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有 RNA 的总...
专题公告
RNA—seq
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1837645/crop1574315821187.jpg', '推荐专题《RNA—seq》（ 分享自 @简书 ）','https://jianshuapi.com/c/acd80cdec328?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}