之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggpl...
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把基因画在染色体上 -
(史上最全)SNP位点与转录因子结合特异性数据库：GVATdb
众所周知，全基因组关联分析（GWAS）发现的很多变异位点基本为非编码，这些变异位点1）要么调控基因表达（eQTL）; 2）要么影响增强子活性; ...
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LTR-RTs的鉴定,LAI值的计算LAI是一种新的评估基因组组装质量的评价标准。LTR讲解[https://www.jianshu.com/p/a93cdbc36339]部分转载...
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DIAMOND: 超快的蛋白序列比对软件
相见恨晚，还好遇到了它 今天用BLASTX将我的转录本序列在UniProt蛋白数据库(700w条序列)中搜索，80个线程，过了1小时大概就分析1...
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生物信息学研究数据库ExPASy：集大成于一体的综合在线工具
ExPASy是一个大型综合性在线工具，用于生物信息学的在线工具合集。https://www.expasy.org/ 有上述图标的是 SIB维护的...
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植物研究常用的数据库总结
1.基因组综合研究数据库 数据库植物网址TAIR拟南芥http://www.arabidopsis.org/[http://www.arabid...
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R拼图包：patchwork和cowplot，magick,aplotggplot2的首席专家Thomas Lin Pedersen发布了patchwork这个包，专业拼图简单好用。patchwork官方地址[ht...
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snpEFF的使用
0.关于snpEff，建议大家去官网[http://snpeff.sourceforge.net/index.html]看一下作者。逝者已去，深...
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差异基因火山图：ggplot2+ggrepelggrepel参考[https://www.jianshu.com/p/84e7e0e029cd]火山图参考[https://www.jians...
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Fastp:质控 +过滤数据
常规的质控和过滤数据是fastqc+trimmomatic，据说fastp更快，而且一次完成质控过滤和出图。fastp的githubfastp的...
专题公告
生信坑，大家一起跳。
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