今天给小朋友数据可视化工具时候，发现国内很多人开发出来数据可视化平台，可以满足许多数据可视化需要。想着干脆整了一个目录贴。简单记录下来，几个我不...
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整理贴 | 生物信息学数据可视化平台~国人作品 -
基于orthofinder 结果构建物种树
串联法 orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，可以直接使用。找到orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列，Spe...
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基因组- genome survey（1）尚未进行基因组测序的物种，在进行基因组测序前，首先需对该物种进行 genome survey。一般通过两个途径：细胞遗传学（这里只讲流式细胞术）...
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用MEGA软件构建NJ树（Neighbor-Joining）MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis)— 分子演化遗传分析 MEGA是一款操作简单的系统...
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MEGA构建进化树如何用MEGA-X构建进化树_生物研究_实用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.co...
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构建发育树 Bootstrap值
即自展值，可用来检验所计算的进化树分支可信度。Bootstrap几乎是构建系统进化树一个必须的选项。一般Bootstrap的值>70%，则认为构...
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使用wgd进行全基因组复制分析这篇教程是我在2019年9月左右分析WGD时的笔记。目前来看，背景介绍和软件使用说明都基本没啥问题。但是现在更建议大家使用wgdi进行比较基因组...
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浅谈全基因组复制
作者：May审稿：童蒙编辑：amethyst 01 什么是全基因组复制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/复制（whole genom...
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mcmctree估算物种分歧时间推断物种系统发育关系以及分歧时间对探讨物种起源与演化具有重要意义。通过最大似然法（ML）构建物种进化树以及估算物种分化时间在比较基因组学的研究进...
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转录组重建系统发育（一）使用fastp多rawdata进行处理rawdata可以是从公司直接获得的测序数据或者是网上下载的数据，网上下载数据的流程参考使用SRA Toolkit下载NCBI-SRA原始数据[...
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