2024年诺贝尔化学奖揭晓，一半授予大卫·贝克（David Baker），以表彰他在计算蛋白质设计领域的卓越贡献；另一半则由德米斯·哈萨比斯（D...
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一文看懂AlphaFold2&3输出结果的json文件内容 -
利用massdatabase包提取物种KEGG通路与基因/化合物对应信息
最近手头处理一批代谢组数据, 想基于几十个关键差异代谢物代谢物进行下KEGG富集，能想到有两种方式解决，一种常用方式就是基于MetaboAnal...
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自己构建物种包OrgDb，然后用clusterProfiler富集分析
利用clusterProfiler进行富集分析时，发现网上没有物种包OrgDb，利用网上教程构建了一个。主要参考了刘小泽的简书，特别感谢一下！！...
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2021-08-19WGCNA确定目标模块后如何找模块内的hubgene
WGCNA 分析确定重要模块之后，如何找模块内的hubgene？ 想找hubgene,必须先理解其概念：网络中处于核心位置的点（基因）。在WGC...
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实验技术（2）——引物设计相关【进入正题】 前面提到的几个探究蛋白互作相关的实验，其实第一步都需要构建合适的质粒，那么就少不了设计靠谱的引物了。 通常来说，引物的设计需要遵守...
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实验技术（1）——载体构建相关常规载体构建原理及流程较为简单，具体操作也比较容易。这里进行简单总结，并对几点需要注意的点进行说明。 原理依赖于限制性核酸内切酶，DNA连接酶和...
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技巧（1）——利用SnapGene构建载体，模拟基因克隆，酶切，连接及电泳检测做实验嘛，时间和精力的合理分配很重要，利用有限的时间高效完成各项实验的准备工作就显得尤其必要。毕竟需要把更多的时间花在研究文献上面，然后仔细验证...
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试图厘清热图相关的一些细节森严森语： 生活中很多时候我都习惯于不知所以而为之，其结果通常坏。原因在于经常的盲目自信和偶尔不愿承认自己的无知。 上篇推文介绍了利用Origi...
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批量设计qPCR引物，可最大限度满足qPCR引物设计的黄金法则森言森语 眼看着十一月又到中旬，时间是过得真快。一个多月没怎么写东西了，实际上是有些懒。 这不马上就要开题论证了，听说定量是最受学生喜爱的实验了...
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