这篇文章更多的是对于混乱的中文资源的梳理,并补充了一些没有提到的重要参数,希望大家不会踩坑。 1. 简介 1.1 背景 WGCNA(weight...
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WGCNA分析基于两个假设:1.相似表达模式的基因可能存在共调控、功能相关或处于同一通路,2.基因网络符合无尺度分布。基于这两点,可以将基因网络...
题目:通过WGNCA发现缺血性卒中相关LncRNA及其靶基因和相关信号通路 LncRNAs related key pathways and g...
本篇代码参考文章:1.生信菜鸟团:一文学会WGCNA分析2.WGCNA(加权基因共表达网络分析)3.WGCNA分析,简单全面的最新教程4.WGC...
单细胞转录组数据分析的时候可以加上wgcna 生信技能树 WGCNA分析大家都不陌生了,我在生信技能树多次写教程分享WGCNA的实战细节: 一文...
一:提取指定模块的基因名 提取基因信息,进行下游分析包括GO/KEGG等功能数据库的注释。 二:模块的导出 主要模块里面的基因直接的相互作用关系...
WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联,以及网络中的...
1.导入数据 导入第一步生成的网络关系和第二步的性状之间的关系。 2. 基因共表达网络可视化 2.1. 使用所有基因绘制 官网推荐了用随机400...
WGCNA分析教程,转自生信技能树分享WGCNA的实战细节: 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版) 通过WGCNA作者的测试数据来学习 重...
WGCNA的理论背景知识[https://www.jianshu.com/p/e102681ec979]WGCNA的详细分析流程[https:/...
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