搬运自哈佛生物信息课程：《Introduction to Single-cell RNA-seq》链接：https://hbctraining....

如果只是做单个样本的sc-RNA-seq数据分析，并不能体会到Seurat的强大，因为Seurat天生为整合而生。 本教程展示的是两个pbmc数...

简介   由于单细胞数据的高维度，基因长度差异，覆盖度差异及实验过程中的偏好性等因素，对前期数据进行有质量的标准化，对后续分析结果解读至关重要。...

简介   目前单细胞数据分析有不少的挑战，比如稀疏矩阵，超高维度数据降维，批次效应校正，聚类算法的选择，多组学数据整合等挑战。有需求就需要造轮子...

随着单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集的逐渐累积，用于分析这些数据的工具数量也在急剧增加。熟悉小张聊科研的同学都知道，此前小编大大们曾...

这篇文章是2019年1月14日发表在Nature Immunology上的一篇文章：Reference-based analysis of lu...

SCENIC: Single-cell regulatory network inference and clustering Abstract...

刘小泽写于19.3.16看了一篇综述，又加了一些扩展知识 文章 这是一篇2017发表在Genome Medicine上的文章A practica...

10xGenomics单细胞转录seurat包提取表达量画小提琴图 需求提取表达画小提琴图对噪音处理 需求 其实seurat包已经有画小提琴图的...

feature selection 比较不同feature selection方法 单细胞转录组测序的确可以一次性对所有细胞都检测到上千个基因的...