在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图，它们可以把跟研究的性状（比如，基因型和身高）显著相关的基因位点清...

(●ˇ∀ˇ●) 函数 layout() 接下来，就可以按照1，2，3数字顺序(没有数字0)进行画图啦！也就是说画的第一张图放在1号位置，第二张图...

写在前面：本文为自己在学习过程中看过各类资料后整理做的笔记，纯属方便自己学习以及后期回顾，也希望有幸能帮助到和我一样的小白们，各位大神如果发现有...

最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，虽然具体还有好多需要微调的地方，先把代码整理分享出来mark一下 前期准备 1.理论知识 强烈...

全基因组关联分析是基于数量性状连锁不平衡理论，通过表型与基因型关联分析获得影响表型性状的显著关联标记。 1. 软件 Tassel / Gaipt...

1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1）按分型百分比条件过滤，多数文章剔除缺失率在20%以上的位点，样本量较大的群体中，可以将缺失...

1、基本统计学概念 假设检验• 零假设(H0):即原假设• 备择假设(H1):与零假设对立的假设• 计算零假设(H0)成立的概率• 如果H0成立...