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seqkit：fasta/fastq序列统计小工具 -
杂记：seqkit计算fasta序列的长度和gc含量；ggpairs更改配色;ggplot2极坐标添加直线计算gc含量 计算序列长度 ggpairs更改配色 这个只是一种方案，还有好多问题没有解决，比如如何给下三角和上三角赋予不同的颜色 代码 欢迎大...
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【块】Gene id格式转换的多种方法
本文将逐步增加各种方法，有时间再研究各个方法的区别。每个人在转换id格式时，可能会遇到很多与以下流程不同的情况。比如说gene id有小版本、去...
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bioconvert：各种各样的生物信息数据格式转换工具今天找计算测序覆盖度的时候发现了这个工具，github 主页是https://github.com/bioconvert/bioconvert[...
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Sambamba 快速去除PCR重复
改软件可快速去除PCR重复，较samtools，picard更快 安装 点击下载后，减压缩即可http://lomereiter.github....
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最全Bedtools使用说明--只看本文就够了1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集，它堪称是基因组分析工具中的瑞士军...
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一款简单好用的lncRNA预测工具：LGC测序技术的飞速发展积累了大量转录组数据，从中也发现了很多新的转录本。区分这些转录本是蛋白编码序列还是非编码序列是基因组注释和新基因鉴定中的重要研...
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从fastq数据到SNV | GATK
00 写在前面 仅针对人类WGS或WES数据，供参考。时间管理某一点：能自动化的工作尽量自动化，不要时间用在毫无意义的重复上。脑袋好比肌肉，需要...
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Cytoscape中文教程（2）7 支持的网络文件格式 Cytoscape可以读取一下格式的文件，这些文件实际是提供了cytoscape和其他一些工具的接口。 Simple i...
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bioawk
bioawk是awk的超集. bioawk能额外解析的生物数据格式 $ bioawk -c help bed:1:chrom 2:start 3...
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