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RNA-seq
收录了9篇文章 · 22人关注
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    水稻GO和KEGG分析

    首先，一般我们分析水稻的数据时候，选用的是MSU和RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件，这里只介绍MSU的ID，RAPDB的同理。 ...

    2.3 热衷组培的二货潜 4 29
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    RNA-seq流程各阶段软件的最优选择

    RNA-seq如今已经成了最受宠爱的生信分析了，而如今琳琅满目的各种生信软件摆在具有新时代选择困难症的同学们眼前我们又犯难了。我们该选择哪套流程...

    0.5 sober01 0 31
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    转录组入门（5）： 序列比对

    欢迎来GitHub上fork，一起进步： https://github.com/xuzhougeng 比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们...

    7.5 xuzhougeng 32 148 3
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    RNA-seq分析流程

    概览 Tophat回贴基因组 Cufflinks拼接转录本 Cuffmerge整合转录本 Cuffdiff计算转录本表达量 使用R绘制热图 绘制...

    0.4 yangmqglobe 0 6
  • GO富集分析＼KEGG

    ##Time:2017-10-8 ##Author:Feng Shengyu #--------------------------------...

    0.4 风中的鱼儿 0 9
  • 生信--RNA-Seq数据分析

    使用的数据，双端测序数据clean data 1 &clean data 2 1、bowtie建库 bowtie2-build genome.f...

    0.5 风中的鱼儿 1 11
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    Bioconductor分析RNA-seq数据

    参考学习《R语言与Bioconductor生物信息学应用》第六章 前言 Y叔的公众号biobabble发过一篇【听说你想学R？】,七月份发的但昨...

    1.7 王诗翔 0 49
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    基因表达分析（上）- 差异表达分析

    基因表达 什么是基因表达，如下是来自于维基百科的解释： 研究方法 定量PCR 这部分我不太懂，所以就放几段百度百科和维基百科的定义。 百度百科 ...

    9.2 xuzhougeng 15 242 1
  • 多重检验的目的和方法

    目的： 多次检验导致的大量假阳性1. 如果是小概率事件（< 5%），我们就抛弃了最初的美好假设（H0：没有差异），认为观测的和预期不一样（接受H...

    0.4 sober01 2 6
  • 关于P-value，及显著与多重检验校正

    P-value：通俗的说就是--犯错误的概率。 在任何一个严谨的科学测量中，我们判断两个数值是否有差异，必须要考虑这个差异可能来源两个方面：可能...

    0.3 sober01 0 10