GEO2R作为GEO在线工具,可以用于表达基因的差异分析。前面介绍过GEO数据包括五种,Platforms、Samples、Series、Dat...
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一般R代码下载其实挺好的,但是网络狗是一件每个探索GEO小伙伴们都要经历的,有时候我们选择更换镜像,想避开蜗牛一般的的网速,但是也是不行,大家就...
1.常规下载方式:prefetch 对于常规下载sra数据来说,NCBI提供了它自己的一套工具(SRA-Toolkit),其中用pref...
身处大数据时代,没钱做实验没关系,无数人正在帮你做实验积累数据;是吗?是的!不信接着往下看! 1. 目前公开的数据非常之多之前我们介绍了NCBI...
现在都是流行追热点,例如m6A这个研究热点,很多人利用它发了n篇纯生信数据挖掘的文章;再比如铁死亡这个研究热点,有一大堆纯数据挖掘的文章正在投稿...
完整流程、注意事项、统计原理:http://blog.sciencenet.cn/blog-118204-1111379.html[http:/...
基于web工具,用户可以对GEO存储的大量数据进行浏览,查询和可视化。通过四种编号GPL,GDS,GSE和GSM可以获得完整的平台,数据集,系列...
1、首先GEO数据库是个什么鬼呢? GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维...
GEO 数据是生信技能树生信爆款入门课程[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&m...
今天从别人的博客中,了解到如何更好地画桑基图,特记录下该代码。 加载R包 导入数据 合并 OTU 丰度、OTU 门水平分类、样本分组 整理成 g...