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CNV
收录了6篇文章 · 8人关注
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    Bedtools genomecov 计算覆盖度

    简单说明: 从2.28.0版开始,bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件,bedtools默认所有的输入文件都以TA...

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    除了GO基因本体论,还有PO、TO、CO等各种Ontology?

    我们最常用最熟悉的功能数据库之一:GO(gene onotology),基因本体论。其实是一套标准词汇术语,目的是从不同角度来描述某个基因的特点...

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    把基因画在染色体上

    之前有一次,我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”,因此,我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后,最终用ggpl...

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    2019-11-08 记录CNV数据分析学习(四)

    昨天在复习Linux基础知识,没有继续记录,今天继续参考学习资料TCGA CNV全攻略 具体数据处理流程见NIH的TCGA官网:https://...

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    GTF与GFF

    一、格式介绍 (一)gtf 文件。GTF 为General Transfer Format缩写,跟 GFF2格式类似。相信大家做转录组分析时候经...

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    CNV calling | DELLY

    基于paired-end mapping methods 和 split-read analysis,检测结构变异。 写在前面 Delly is...

    1.8 fatlady 9 22
  • 使用Plink对CNV做GWAS分析(一)

    Introduction 随着高通量测序技术的发展,这些年关于CNV(拷贝数变异)的研究也逐渐多了起来。以往CNV主要通过PCR或者CGH芯片等...

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