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CNV
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    Bedtools genomecov 计算覆盖度

    简单说明： 从2.28.0版开始，bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件，bedtools默认所有的输入文件都以TA...

    3.6 斩毛毛 0 6
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    除了GO基因本体论，还有PO、TO、CO等各种Ontology？

    我们最常用最熟悉的功能数据库之一：GO（gene onotology），基因本体论。其实是一套标准词汇术语，目的是从不同角度来描述某个基因的特点...

    2.1 生物信息与育种 0 7
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    把基因画在染色体上

    之前有一次，我导说“能不能把这些基因按顺序画在果蝇的染色体上”，因此，我寻找了一些实现这个需求的方法。经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggpl...

    11.5 果蝇饲养员的生信笔记 10 112
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    2019-11-08 记录CNV数据分析学习（四）

    昨天在复习Linux基础知识，没有继续记录，今天继续参考学习资料TCGA CNV全攻略 具体数据处理流程见NIH的TCGA官网：https://...

    0.2 程凉皮儿 1 6
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    GTF与GFF

    一、格式介绍 （一）gtf 文件。GTF 为General Transfer Format缩写，跟 GFF2格式类似。相信大家做转录组分析时候经...

    0.8 枫狂灬呆子 0 10
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    CNV calling | DELLY

    基于paired-end mapping methods 和 split-read analysis，检测结构变异。 写在前面 Delly is...

    1.8 fatlady 9 22
  • 使用Plink对CNV做GWAS分析（一）

    Introduction 随着高通量测序技术的发展，这些年关于CNV（拷贝数变异）的研究也逐渐多了起来。以往CNV主要通过PCR或者CGH芯片等...

    1.1 银色麦穗 7 35

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