原本以为毕业了就起飞了,没想到,喵的比没毕业还累...又鸽了仨月,这个小插件到时完善了不少,但是上次承诺的视频还是没有录。原因不说了,准备手打!...
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原文来自这里,略编辑 摘要 简单且高效地分析RNA测序数据的能力是Bioconductor的核心优势。 RNA-seq分析通常从基因水平的序列计...
在从零开始学Circos绘制圈图(一)我们已经绘制出一个比较丑的circos图,这一部分是讲解一些细节。 这一部分会从上一步的两个文件开始,分别...
一般基因组文章都会有下面这种酷炫图,用来描述基因组的基因密度分布,转座子的密度分布,和其他物种或者多倍体的多套染色体间的共线性关系,以及其他各种...
转录组学习一(软件安装) 转录组学习二(数据下载) 转录组学习三(数据质控) 转录组学习四(参考基因组及gtf注释探究) 转录组学习五(...
小RNA测序的数据要多看一下adapter。 拿我下载的数据来看,reads读长是51,但小RNA的长度基本都是20多点(21,24),肯定会把...
使用Snakemake搭建分析流程 目前已有的框架 A review of bioinformatics pipeline framework ...
我们在做生物分析的时候,经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字,甚至连内容都极为相似~那么,他们究竟差在哪里呢?...
前几天,帮师妹分析转录组数据,由于她只需要FPKM,并且我刚好在学snakemake,就试着用 snakemake 写了一个简单的从 raw d...
这个时候已经不是表达矩阵的事情了,要从新从fastq测序数据开始。对测序后的fastq数据进行转录本的组装。基于组装后的转录本,通过数据库注释去...
专题公告
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