前言 对于很多小伙伴来说，刚入手生信时接触最多的就是差异分析，即在基因组层面可以算突变率差异，转录组层面可以算基因表达水平差异，表观组可以观察甲...
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一文理清常见的基因富集分析
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祖先状态重建—揭示物种性状的起源与演化我觉得处理任何事情，不仅要做到“知其然”，还要做到“知其所以然”。在做事情时，如果仅知道低头蛮干，不知道抬头看路；只知道跟着“牵牛绳”的方向，在...
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论文日鉴16:综合生信工具网站Bio.tools bio.tools · Bioinformatics Tools and Services Discovery Portal...
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Sam/Bam文件格式详解
作者：麦茬道审稿：童蒙编辑：amethyst 随着生物信息数据的爆发式增长，存储生物信息的文件格式也多样化起来，不同的文件格式往往有不同的目的：...
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infernal预测ncRNA
一：下载安装 二：下载数据库 三： 确定待查询的核苷酸序列或基因组的大小，作为后续命令的参数 其输出结果中有一行，Total # of resi...
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快速 | 蛋白序列两两相似度矩阵计算写在前面 Emmm，有时候，我们可能通过一些比对软件，如 BLAST , DIAMON 或者 ghostz 得到一堆序列比对结果。当然，我们也可...
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Hyphy，不亚于Paml的选择压力分析的优秀软件，使用指北
近几年来，Hyphy的使用人数越来越来多，虽然不及paml，但这款软件的一些优秀特性使得它值得受到使用和关注。首先相比paml，hyphy有以下...
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Merqury评估基因组质量一款用于评估基因组质量的新方法 一般用于评估的方法 二代reads 比对率； 偏向于重复序列... BUSCO；仅仅能检测单拷贝 最近，GEno...
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如何利用泛基因组来深度发掘一个物种？
作者：童蒙编辑：amethyst 大豆是一种非常重要的油料和蛋白质来源。为了研究其基因组多样性，需要构建高质量的泛基因组。作者denovo组装了...
专题公告
群体遗传学
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