DCA曲线简介 DCA是一种评估临床预测模型、诊断试验和分子标记物的简单方法。传统的诊断试验指标如：敏感性，特异性和ROC曲线下面积仅测量预测模...
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TCGA+biomarker——决策曲线分析法（DCA）
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R语言可视化（二十八）：瀑布图绘制28. 瀑布图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用waterfalls包绘制瀑布图 使用maftools包绘制瀑布图 使用GenVis...
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统俗讲义之——如何计算统计功效(Statistical Power)
通俗统计之——如何计算统计功效（部分内容受教于网络，经个人理解阐述于此，不限版权，尽管转载） 1. 何为‘统计功效’？ 统计功效，是用来描述，在...
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Metascape写在前面，有做广告的嫌疑，哈哈，2019.4刚发表的，不过貌似每发表之前引用率超高，貌似专门针对david，不过david真的过时了，这个网站也...
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神图-多组学通路富集的联合比较
使用Perseus软件进行1D和2D annotation enrichment分析 某天，在某篇蛋白组学文献中看到这么一个分析，称为2D an...
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利用igraph包可视化基于KNN的单细胞聚类关系0、背景 （1）在Seurat等包中，在进行挑选高变基因，PCA分析后，多使用SNN(shared nearest neighbor)算法进行单...
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ssGSEA
参考连接：https://shengxin.ren/article/403[https://shengxin.ren/article/403]s...
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GSVA + limma进行差异通路分析
一般我们做GSEA都是先进行差异基因分析，然后取差异倍数排序结果进行GSEA。但如果你没有条件进行差异基因分析也可以进行GSEA，这就是ssGS...
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Pathway通路与GSEA基因集有何区别？刘小泽写于19.3.19通常做富集分析时，我们会遇到两种方法Pathway和GSEA，它们到底有什么区别？ 前言 我们通过差异分析会得到一些差异...
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关于批次效应的若干问题
批次效应定义 我们引用文献里面的原文：Tackling the widespread and critical impact of batch ...
专题公告
统计知识
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