前言 WGDI软件对于比较基因组分析非常实用，能够分析全基因组复制事件，识别同源区块，画共线性点阵图，求ka、ks值等，小编接下来先带你安装该软...
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WGDI软件（一）：安装与配置
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WGDI | 比较基因组分析神器，要啥有啥！写在前面 Emmm，前面推送了几期好基友-比较基因组小王子的 WGDI 软件使用和比较基因组图表解读。后台常常受到消息，大体意思“快更新！”。原...
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用以判断选择压力的Ka/Ks的计算前言 最近在看一些关于生态、遗传、基因组进化等的文献，其中有个很多人用的也用了很久的用以判断物种选择压力的数值，（Ka/Ks）。发现在国内的资料...
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组学工具合集
组学工具合集 整理了一些目前知道的与组学相关的工具，可能不全面，欢迎补充 基因组学 一代组装 Celera Assembler: 最具代表性的工...
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全基因组复制 WGD |（二）Ka/Ks及4Dtv值计算转自：https://www.jianshu.com/p/9d28de3d18e6[https://www.jianshu.com/p/9d28...
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如何用WGDI进行共线性分析(下)
在上一篇教程的最后，我写道「我们能够更加直观的观察到2个peak，基本确定2个多倍化事件」。这里就引出了一个问题，为什么我们可以根据peak来推...
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如何用WGDI进行共线性分析(中)
Ks可视化 我们在上一篇如何用WGDI进行共线性分析(一)[http://xuzhougeng.top/archives/comparative...
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如何用WGDI进行共线性分析(上)多倍化以及后续的基因丢失和二倍化现象存在于大部分的物种中, 是物种进化的重要动力。如果一个物种在演化过程中发生过多倍化，那么在基因组上就会存在一...
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WGD（全基因组复制）分析——Ka/Ks及4Dtv值计算一、4Dtv（四倍简并位点颠换率）的定义 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative)...
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【豆科基因组】绿豆Mungbean, Vigna radiata基因组2014NC来源 Kang, Y., Kim, S., Kim, M. et al. Genome sequence of mungbean and ins...
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