在高通量测序数据的分析中，仅仅靠raw read counts描述基因的表达量是远远不够的。受限于测序过程中的技术因素影响，read count...
投稿
收录了14篇文章 · 10人关注
-
理论 | 简述RPKM，FPKM，TPM -
关于heatmap一、热图的介绍 （1）什么是热图 热图是heatmap的直译，用暖色表示数值大，冷色表示数值小。行为基因，列为样本。 （2）热图的作用 数据质量...
-
豆豆文献阅读第二天文章题目：Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HI...
-
StringTie + DESeq2 进行 RNA-seq 差异基因分析按：RNA-seq 流程非常多样化，每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 read counts 数值，DE...
-
「学转录组入门生信」四周实战总结在四周之前，我写了一篇推送一个月能通过转录组入门生信吗？，于是开启了我的‘四周通过实战入门转录组’计划。现在四周结束了，我对这个计划进行一个阶段...
-
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM to...
-
RNA-seq分析简洁版前面RNA-seq分析：从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍，这次利用RNA-seq(2)-2:下载数据中下载的肝癌数据进行分...
-
RNA-seq完整分析过程linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是...
-
转录组分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?...
-
RNA_seq（1）植物转录组差异基因分析简单练习
RNA_seq植物实战 Author : yujia 目录：概述salmon工具完成索引建立和生物学定量subread工具完成序列比对和定量DE...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1809692/2345_image_file_copy_2.jpg', '推荐专题《转录组实战》（ 分享自 @简书 ）','https://jianshuapi.com/c/7c77b2fb71ef?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}