写在前面 约莫一个月前,不知为何,突然收到好几个朋友问了一些TBtools的使用问题。按照我个人的设想,TBtools的使用应该不会存在使用问题...
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tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要,去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效...
本次笔记内容:cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {s...
我通过查资料获得已知达松维尔拟诺卡氏菌亚种(cardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei)的基因组原始...
作为一个统计遗传学实验室里的学生,怎么可以不会GWAS分析,虽然学的是生物信息学,但是每天听师兄师姐在那里讨论这个模型,那个矩阵啥的,多多少少有...
要学习这一节,首先是要学习什么是主成分,什么是聚类这个我一直有点搞混,可以百度谷歌查一查http://www.cnblogs.com/pinar...
这一节说的是association analysis 也是我们分析单标记回归得到的结果(P值)的一步,这一步的结果可以用来与我第一讲 联合起来,...
学会了基本的plink之后,就要开始学习了解输入文件的格式了。详细的格式建议看官网因为之前以及接触过几次,这里来个详细的归总主要认识 ped m...
首先制作bed格式的文件包含基因组全部的外显子区域坐标如下: 从vcf文件中提取位于exon区域的变异位点
上次我是把bed bim fam 转成 vcf ,这次反过来,我已有的vcf 文件,要转成 bed bim fam. 上网查了查,发现plink...