一、基因组 PacBio SMRTbell文库的构建流程 1. PacBio SMRTbell 文库的结构 PacBio测序平台构建完成的测序文...
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一、基因组 PacBio SMRTbell文库的构建流程 1. PacBio SMRTbell 文库的结构 PacBio测序平台构建完成的测序文...
一、SNPs和INDELs变异检测 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)指的是基因组中单个核苷...
如果将个体基因组与参考基因组相比,变异的数量是巨大的。据估计(1),全球范围内人类的基因组中总共有超过8800万个变异(包括约8470万个单核苷...
一、Minimap2 使用 官方网站:https://github.com/lh3/minimap2[https://github.com/lh...
以Pacific Biosciences (PacBio)公司为代表的第三代单分子实时荧光测序平台为以测序为基础的科学研究带来了革命性的突破。目...
基因组结构变异(structure variant, SV)是基因组变异的重要组成部分,大片段插入(Insertion, INS)、缺失(Del...
我也认为长读长测序是 RNA 测序的未来!随着价格的降低和碱基质量的提升,传统的二代RNA-seq会被逐渐取代。 很多物种的转录本非常多样和复杂...
通过isoseq collapse和pigeon,我们最终能得到带有基因注释的表达矩阵,后续基因的差异分析,差异基因的KEGG注释等都和二代RN...
对于二代测序,可以使用fastQC[https://github.com/s-andrews/FastQC]软件对原始下机数据质量进行全面的统计...
ONT全长转录组测序是指基于牛津纳米孔公司(Oxford Nanopore Technologies,ONT)三代测序平台进行的全长转录组测序。...
专题公告
1. 三代测序生物信息学分析流程搭建与分享;
2. 三代测序相关文章生信分析的复现;
3. 三代测序应用挖掘与转化;
4. 三代测序相关科研成果分享 - 邀请学术大咖;
5. 三代测序行业发展 - 邀请企业大咖。