Venn图经常用于表现组间重叠元素的数量信息。但是随着分组数量的增多，Venn图的结构会越渐复杂，如下所示，当分组数量为5组时，已经不容易从中识...
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Venn图难以展示大于5组的集合怎么办？用UpSet图表示 -
文献(2): 综述_癌症相关成纤维细胞(CAF)的异质性【建议收藏】
上一个单细胞课题做了一些关于CAF的工作，当时就参考了这一篇综述。细胞亚群的解读算是单细胞课题中耗时耗力的内容，非免疫细胞更是如此，因为非免疫细...
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GSEA笔记GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis，中文翻译就是基因集富集分析，最早提出GSEA的文章是下面...
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python实现绘制ROC曲线寻找指标最佳诊断临界值实现功能： 根据患者的诊断结果以及某一个诊断指标数值，绘制ROC曲线，寻找出这个指标的最佳诊断临界值，并在曲线中标记出此时的坐标。 实现代码： ...
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14.GO富集分析R语言代码及5种图的绘制一、举例回顾 本节使用GSE1009数据集，已经用limma包对数据集中的样本进行差异分析，现对差异基因(DEGs)做GO富集分析。 GSE10...
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R数据可视化13:瀑布图/突变图谱突变相关分析的时候我们经常会选择瀑布图进行展示，瀑布图看起来十分的复杂高端，但是实际上只需要用一个GenVisR的R包即可解决。今天就让我们来看...
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超几何分布检验（hypergeometric test）以及R中实现超几何分布检验常用来对venn图两个圈overlap的显著性进行检验设总共有29个人，其中11个吸烟者，18个非吸烟者，现从中随机抽取16个样本...
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TCGA+biomarker——单因素Cox回归
生存分析KM法与Cox法异同 KM 方法即Kaplan-Meier survival estimate是一种无参数方法(non-parametr...
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WGCNA分析WGCNA基本概念 加权基因共表达网络分析 (WGCNA, Weighted correlation network analysis)是用来描...
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零基础学生信入门笔记(R语言、Linux、Python、RNA-seq、单细胞测序、质谱流式、TCGA、GEO、单细胞经典文献解读)
医学生零基础学生信是先学Python还是先学R语言？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何学习...
专题公告
火山图、热图、ROC生存曲线等
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